청주대학교 공과대학의 교육목표는 모든 학부와 전공간에 상호 유기적인 관련을 가지면서 심오한 이론과 실용적 응용방법을 체계적으로 연구·교육하여, 기술·과학도로서의 기초소양과 전문지식을 갖추고 창의적인 문제 해결능력과 종합적인 인격을 갖춘 유능한 인재를 양성하여 지역사회와 국가 산업발전에 기여하고 나아가 인류사회에 봉사하는데 있다.

특히, 중부권 중핵산업도시로서 급성장하고 있는 청주를 비롯한 지역사회가 필요로 하는 고급기술인력의 공급원으로서 산·학·연 협동체제의 중추적 역할을 수행하기 위한 공과대학의 구체적인 목표는 다음과 같다 .
기초과학과 응용과학의 유기적인 협조체제 속에서 기초과학도와 첨단산업의 역군이 될 수 있는 고급인력을 양성한다.
전공영역의 기본적 원리와 실용적 응용방법을 터득하고, 지식과 정보를 창의적으로 적용하여 세계화, 정보화 사회에 적용하도록 한다.
다양한 문화를 폭 넓게 수용하고, 법과 질서를 준수하여 협동심과 책임의식을 갖게 한다.
지식과 정보를 현장에서 효과적으로 활용하기 위한 실용적 방법을 습득케 하며 공동체 이익을 위한 가치체계를 확립한다.